RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf172	C9J069	976 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPS15	P42566	896 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOX9	P48436	509 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDK8	P49336	464 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	HAND2	P61296	217 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADGRE1	Q14246	886 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFAP100	Q494V2	611 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTR9	Q6PD62	1173 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	REC114	Q7Z4M0	266 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF181	Q9P0P0	153 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	REC8	O95072	547 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGR	P09769	529 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANTXR2	P58335	489 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERVK-24	P63145	666 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	APOBR	Q0VD83	1088 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLK2	Q6UY11	383 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	NKD1	Q969G9	470 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP40	Q9NVE5	1235 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNTNAP1	P78357	1384 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	DTNB	O60941	627 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGSF3	O75054	1194 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	LDHC	P07864	332 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLFN14	P0C7P3	912 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADH5	P11766	374 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSK3A	P49840	483 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLCD1	P51178	756 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	JAG1	P78504	1218 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ID3	Q02535	119 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST3GAL1	Q11201	340 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	MBTPS1	Q14703	1052 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR162	Q16538	588 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CASC1	Q6TDU7	716 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	JDP2	Q8WYK2	163 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC14	Q96N46	770 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	GINM1	Q9NU53	330 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	FLT1	P17948	1338 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEDD4	P46934	1319 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	UTRN	P46939	3433 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLRN2	A0PK11	232 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRBA1	A5PL33	1030 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266		E7EWF7	191 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNT10B	O00744	389 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALX3	O95076	343 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOS3	P29474	1203 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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