RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 HS1BP3Q53T59 392 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 GPRASP2Q96D09 838 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 IL17RAQ96F46 866 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SHTN1A0MZ66 631 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 POTEFA5A3E0 1075 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 K7ERI5 159 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PDHXO00330 501 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 VWA5AO00534 786 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 POTEIP0CG38 1075 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 INHBEP58166 350 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 POTEGQ6S5H5 508 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SHC4Q6S5L8 630 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 DPH6Q7L8W6 267 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 NBPF11Q86T75 865 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 KLRG1Q96E93 195 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 NEBLO76041 1014 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 CYP2B6P20813 491 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC41Q15345 812 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 TNNT1P13805 278 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 STAT5BP51692 787 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PP2D1A8MPX8 630 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 GH1P01241 217 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 KRT9P35527 623 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SREBF1P36956 1147 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 GNG11P61952 73 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC63Q05C16 580 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PKN1Q16512 942 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 GBP6Q6ZN66 633 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM22K7EJ46 135 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 EYA4O95677 639 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 RGS2P41220 211 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PEX3P56589 373 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ASIC2Q16515 512 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 XKR3Q5GH77 459 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 RNF169Q8NCN4 708 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ABCA3Q99758 1704 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 TACC1O75410 805 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 TUBB4AP04350 444 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 TNFAIP3P21580 790 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ITGB4P16144 1822 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SNX16P57768 344 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 CUL4BQ13620 913 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 C7orf31Q8N865 590 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 RDM1Q8NG50 284 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 NLRP4Q96MN2 994 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 NOX5Q96PH1 765 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 MTRQ99707 1265 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 TIPINQ9BVW5 301 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 NHSQ6T4R5 1651 aa9.09□□□□□ -0.96
PTPRD-211ENST00000486161 STRNO43815 780 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-211ENST00000486161 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-211ENST00000486161 Q3C1V9 767 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-211ENST00000486161 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-211ENST00000486161 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-211ENST00000486161 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms