RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 ERVK-21P61565 698 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 ADAM17P78536 824 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP4P98171 946 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 MICU3Q86XE3 530 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 TMTC2Q8N394 836 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 FANCBQ8NB91 859 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 MTA3Q9BTC8 594 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 EFCAB14O75071 495 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 UPP2O95045 317 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 AMHP03971 560 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 MARK3P27448 753 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 LIFRP42702 1097 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 NLRX1Q86UT6 975 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 PGBD1Q96JS3 809 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 CHRNA1P02708 482 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 CALM1P0DP23 149 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 CALM2P0DP24 149 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 CALM3P0DP25 149 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 SEPT8Q92599 483 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 HLA-CQ95604 372 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 GPRASP2Q96D09 838 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 INSL6Q9Y581 213 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 GNAT1P11488 350 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 MTMR1Q13613 665 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 AAK1Q2M2I8 961 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 APOA5Q6Q788 366 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 RASEFQ8IZ41 740 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 BACH2Q9BYV9 841 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 COG5Q9UP83 839 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 CAND2O75155 1236 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 GHRP10912 638 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 COL9A1P20849 921 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 GRIK4Q16099 956 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 FAM26DQ5JW98 314 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 TOP1MTQ969P6 601 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 PCYT2Q99447 389 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 JADE2Q9NQC1 790 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 NRCAMQ92823 1304 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 IGBP1P78318 339 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 MGAT3Q09327 533 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 FUT2Q10981 343 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 PPFIA1Q13136 1202 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 GLG1Q92896 1179 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 NEK1Q96PY6 1258 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 YME1L1Q96TA2 773 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 TMEM260Q9NX78 707 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.46□□□□□ -0.09
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTS3O15072 1205 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 SEC24BO95487 1268 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 ARP10275 920 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 CPA1P15085 419 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 NAPAP54920 295 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 LPIN1Q14693 890 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 EPC2Q52LR7 807 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 CDHR1Q96JP9 859 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.45□□□□□ -0.1
PRAME-212ENST00000485532 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms