RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460236.5

PHF20L1-211, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 3,393 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-211ENST00000460236 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.32□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.32□□□□□ -1.4
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PHF20L1-211ENST00000460236 CALML4Q96GE6 196 aa6.32□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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PHF20L1-211ENST00000460236 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.32□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 IL31RAQ8NI17 732 aa6.32□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 GMCL1Q96IK5 515 aa6.32□□□□□ -1.4
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PHF20L1-211ENST00000460236 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.32□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.32□□□□□ -1.4
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PHF20L1-211ENST00000460236 ZBTB39O15060 712 aa6.31□□□□□ -1.4
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PHF20L1-211ENST00000460236 ADCY5O95622 1261 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 SERPINC1P01008 464 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 USP14P54578 494 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 CNTN2Q02246 1040 aa6.31□□□□□ -1.4
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PHF20L1-211ENST00000460236 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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PHF20L1-211ENST00000460236 SCINQ9Y6U3 715 aa6.31□□□□□ -1.4
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PHF20L1-211ENST00000460236 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 E9PMD0 336 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 FAM86B1E9PN63 330 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 CBFA2T2O43439 604 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 GAS7O60861 476 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 PPP6R2O75170 966 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 RBP3P10745 1247 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 HTRA3P83110 453 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 RESP18Q5W5W9 173 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 ATL3Q6DD88 541 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.31□□□□□ -1.4
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PHF20L1-211ENST00000460236 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 ARP10275 920 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 ZNF445P59923 1031 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 STX1AQ16623 288 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 CCL15Q16663 113 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 FAM160B2Q86V87 743 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 TNFRSF25Q93038 417 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 GINM1Q9NU53 330 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.31□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 LTBP1Q14766 1721 aa6.3□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 MYH6P13533 1939 aa6.3□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 VWA5AO00534 786 aa6.3□□□□□ -1.4
PHF20L1-211ENST00000460236 BACH1O14867 736 aa6.3□□□□□ -1.4
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