RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 ZCWPW2Q504Y3 356 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NAA35Q5VZE5 725 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SYNE4Q8N205 404 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MTMR9Q96QG7 549 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GMNCA6NCL1 334 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 C5orf60A6NFR6 353 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM187AA6NFU0 413 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TBX3O15119 743 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF185O15231 689 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GGPS1O95749 300 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MYBL2P10244 700 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 FERP16591 822 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP2K2P36507 400 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GYG1P46976 350 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS8P62241 208 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP27A1Q02318 531 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GUCY2DQ02846 1103 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NFIL3Q16649 462 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 LETM2Q2VYF4 491 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TTMPQ5BVD1 217 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HGSNATQ68CP4 663 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NLRP14Q86W24 1093 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ERMNQ8TAM6 284 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MORC4Q8TE76 937 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SEC14L1Q92503 715 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NLRP3Q96P20 1036 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.054e-6■□□□□ 9.2
CAPNS1-202ENST00000586851 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE4BO95155 1302 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.46□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 FOCADQ5VW36 1801 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP73A6NFT4 308 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC169A6NNP5 214 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 C21orf2O43822 256 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF4AO95239 1232 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 LMNB1P20700 586 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP5DP30049 168 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 FNTAP49354 379 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 LIG3P49916 1009 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SIK1P57059 783 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 RASSF7Q02833 373 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 GRB10Q13322 594 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.46□□□□□ -1.06
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