RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557215.5

CLMN-208, Transcript of calmin, human

TSL 3

Gene CLMN, Length 515 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLMN-208	ENST00000557215	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	PGK2	P07205	417 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	ATP2B1	P20020	1258 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	ADORA2A	P29274	412 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	UBXN2A	P68543	259 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	CNTN2	Q02246	1040 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	SP3	Q02447	781 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	INF2	Q27J81	1249 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	TBCK	Q8TEA7	893 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	GPR25	O00155	361 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	STRN	O43815	780 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	SREBF1	P36956	1147 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	FCGRT	P55899	365 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	ARHGAP4	P98171	946 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	GRB14	Q14449	540 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	NEK8	Q86SG6	692 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	RMDN3	Q96TC7	470 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	PXMP2	Q9NR77	195 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	RPTOR	Q8N122	1335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	RFX1	P22670	979 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	CTGF	P29279	349 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	PSMC4	P43686	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	KIF22	Q14807	665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	LETM2	Q2VYF4	491 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	TTC38	Q5R3I4	469 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	DPP9	Q86TI2	863 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CLMN-208	ENST00000557215	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ASTN1	O14525	1302 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	WNT7A	O00755	349 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	COBL	O75128	1261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	TRAPPC10	P48553	1259 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PGM5	Q15124	567 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	DNER	Q8NFT8	737 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	IL31RA	Q8NI17	732 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	EDIL3	O43854	480 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	FKTN	O75072	461 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	TDP2	O95551	362 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CYP3A4	P08684	503 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CCND2	P30279	289 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MCM7	P33993	719 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ZNF76	P36508	570 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	USP11	P51784	963 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	KRT85	P78386	507 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PDE4C	Q08493	712 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ZNF174	Q15697	407 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	FGD4	Q96M96	766 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	UCN2	Q96RP3	112 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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