RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 GH1P01241 217 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 ARP10275 920 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 PTK7Q13308 1070 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 CAMK1Q14012 370 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 USH1GQ495M9 461 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 TBC1D10CQ8IV04 446 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 FBXL6Q8N531 539 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 TOP1MTQ969P6 601 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 FAM50BQ9Y247 325 aa16.08■□□□□ 0.16
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CS-231ENST00000552222 CYP21A2P08686 494 aa16.07■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 RSPH10BP0C881 870 aa16.07■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
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CS-231ENST00000552222 NECTIN1Q15223 517 aa16.07■□□□□ 0.16
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CS-231ENST00000552222 CLEC1BQ9P126 229 aa16.07■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 CD207Q9UJ71 328 aa16.07■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 NLRC5Q86WI3 1866 aa16.06■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 HAS3O00219 553 aa16.06■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 CASTP20810 708 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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CS-231ENST00000552222 ASIC4Q96FT7 647 aa16.06■□□□□ 0.16
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CS-231ENST00000552222 DCHS1Q96JQ0 3298 aa16.06■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 CACNA1AO00555 2505 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 EFCAB14O75071 495 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 ADAM15Q13444 863 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 MSLNLQ96KJ4 702 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 TAF6LQ9Y6J9 622 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 SPTBN4Q9H254 2564 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 NEDD4P46934 1319 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 SLC27A2O14975 620 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 TREHO43280 583 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
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CS-231ENST00000552222 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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CS-231ENST00000552222 DGKDQ16760 1214 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 C8orf34Q49A92 452 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.04■□□□□ 0.16
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CS-231ENST00000552222 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.167e-8■■■□□ 18
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CS-231ENST00000552222 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 TELO2Q9Y4R8 837 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 DMDP11532 3685 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 BMPR1AP36894 532 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 NT5C2P49902 561 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 SERINC5Q86VE9 423 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 FIBCD1Q8N539 461 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 DNERQ8NFT8 737 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 USP26Q9BXU7 913 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 CNNM2Q9H8M5 875 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 TOMM22Q9NS69 142 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 E7EWF7 191 aa16.02■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
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CS-231ENST00000552222 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.02■□□□□ 0.16
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CS-231ENST00000552222 KCNB2Q92953 911 aa16.02■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 IL17RAQ96F46 866 aa16.02■□□□□ 0.16
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CS-231ENST00000552222 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa16.01■□□□□ 0.15
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CS-231ENST00000552222 SEC24BO95487 1268 aa16.01■□□□□ 0.15
CS-231ENST00000552222 PDHBP11177 359 aa16.01■□□□□ 0.15
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CS-231ENST00000552222 NOVP48745 357 aa16.01■□□□□ 0.15
CS-231ENST00000552222 SP2Q02086 613 aa16.01■□□□□ 0.15
CS-231ENST00000552222 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CS-231ENST00000552222 TSGA10IPQ3SY00 556 aa16.01■□□□□ 0.15
CS-231ENST00000552222 RNF20Q5VTR2 975 aa16.01■□□□□ 0.15
CS-231ENST00000552222 STOX1Q6ZVD7 989 aa16.01■□□□□ 0.15
CS-231ENST00000552222 SEPT8Q92599 483 aa16.01■□□□□ 0.15
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