RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485989.6

TACC3-210, Transcript of transforming acidic coiled-coil containing protein 3, human

TSL 3

Gene TACC3, Length 726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TACC3-210	ENST00000485989	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	UIMC1	Q96RL1	719 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	GPR20	Q99678	358 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	14.64	□□□□□ -0.07	2e-7	■■□□□ 12.3
TACC3-210	ENST00000485989	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	JADE2	Q9NQC1	790 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	AP3B2	Q13367	1082 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	HIC1	Q14526	733 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	C8orf34	Q49A92	452 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989		Q7L0L9	218 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	C7orf31	Q8N865	590 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	AIFM3	Q96NN9	605 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	C6orf50	Q9HD87	102 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	ESYT2	A0FGR8	921 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	HAS3	O00219	553 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	PPFIA4	O75335	1185 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	LARGE1	O95461	756 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	AR	P10275	920 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	ZNF76	P36508	570 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	SREBF1	P36956	1147 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	ARHGAP4	P98171	946 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	TMEM240	Q5SV17	173 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	NLRP5	P59047	1200 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	ZNF365	Q70YC5	407 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	SESTD1	Q86VW0	696 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	NECAB1	Q8N987	351 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	WNT8B	Q93098	351 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	CDHR1	Q96JP9	859 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	IL23A	Q9NPF7	189 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	SCN5A	Q14524	2016 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	FAM86B1	E9PN63	330 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989		H3BRB1	525 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	PFKFB2	O60825	505 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	DEXI	O95424	95 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	MARK3	P27448	753 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	GNA11	P29992	359 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	NEK4	P51957	841 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	CEP55	Q53EZ4	464 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	FAM161B	Q96MY7	647 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	FOSB	P53539	338 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	BFSP2	Q13515	415 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	RETREG2	Q8NC44	543 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	VWCE	Q96DN2	955 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TACC3-210	ENST00000485989	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	CTDNEP1	O95476	244 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	IQCF3	P0C7M6	154 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	ANKRD1	Q15327	319 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	ME3	Q16798	604 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	DEFB123	Q8N688	67 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	BICD2	Q8TD16	824 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	IL17RA	Q96F46	866 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	SDF4	Q9BRK5	362 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TACC3-210	ENST00000485989	SETD4	Q9NVD3	440 aa		14.58	□□□□□ -0.08

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