RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 GPR20Q99678 358 aa27.4■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 WNT8AQ9H1J5 351 aa27.4■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 PKD2L1Q9P0L9 805 aa27.4■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.4■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 SZT2Q5T011 3432 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 DOCK5Q9H7D0 1870 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 ATP9AO75110 1047 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 LGALS2P05162 132 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 ACRP10323 421 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 GNA11P29992 359 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 C16orf59Q7L2K0 433 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 MXRA8Q9BRK3 442 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 C16orf70Q9BSU1 422 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 IL23AQ9NPF7 189 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.39■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 MAFGO15525 162 aa27.38■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 KCNA2P16389 499 aa27.38■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 SREBF1P36956 1147 aa27.38■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 VPS54Q9P1Q0 977 aa27.38■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 H3BRB1 525 aa27.37■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD1Q15327 319 aa27.37■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM240Q5SV17 173 aa27.37■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 MCTP2Q6DN12 878 aa27.37■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 GPR153Q6NV75 609 aa27.37■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 RETREG2Q8NC44 543 aa27.37■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 CYP2W1Q8TAV3 490 aa27.37■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 IL17RAQ96F46 866 aa27.37■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 SCLYQ96I15 445 aa27.37■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
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SMKR1-201ENST00000462322 TELO2Q9Y4R8 837 aa27.37■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF76P36508 570 aa27.36■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP4P98171 946 aa27.36■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 BFSP2Q13515 415 aa27.36■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 CEP55Q53EZ4 464 aa27.36■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF365Q70YC5 407 aa27.36■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 BICD2Q8TD16 824 aa27.36■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 KCNH7Q9NS40 1196 aa27.36■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.36■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 PITPNM1O00562 1244 aa27.35■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTS3O15072 1205 aa27.35■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 DEXIO95424 95 aa27.35■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 AK2P54819 239 aa27.35■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC155Q8N6L0 562 aa27.35■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 CTAGE1Q96RT6 745 aa27.35■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 SH3GLB2Q9NR46 395 aa27.35■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 NLRP5P59047 1200 aa27.34■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 SCRN1Q12765 414 aa27.34■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM50Q86XT4 487 aa27.34■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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SMKR1-201ENST00000462322 PFKFB2O60825 505 aa27.33■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 CDKL5O76039 1030 aa27.33■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 FGBP02675 491 aa27.33■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 ARP10275 920 aa27.33■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 CAGE1Q8TC20 777 aa27.33■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 RASGRP4Q8TDF6 673 aa27.33■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.33■■□□□ 1.97
SMKR1-201ENST00000462322 NEK4P51957 841 aa27.32■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 SDF4Q9BRK5 362 aa27.32■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 CYP3A4P08684 503 aa27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 IQCF3P0C7M6 154 aa27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 PTK7Q13308 1070 aa27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 NIPA1Q7RTP0 329 aa27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 DEFB128Q7Z7B8 93 aa27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 DEFB123Q8N688 67 aa27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 C17orf102A2RUQ5 167 aa27.3■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 RFC2P35250 354 aa27.3■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 C8orf34Q49A92 452 aa27.3■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 Q7L0L9 218 aa27.3■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 OTOP2Q7RTS6 562 aa27.3■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 PLA2G4DQ86XP0 818 aa27.3■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 AFAP1L1Q8TED9 768 aa27.3■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 CRYGNQ8WXF5 182 aa27.3■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 HERVK_113Q902F9 699 aa27.3■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 SLC9A2Q9UBY0 812 aa27.3■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 FAM86B1E9PN63 330 aa27.29■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 PFKMP08237 780 aa27.29■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 FAM86B2P0C5J1 330 aa27.29■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 HIC1Q14526 733 aa27.29■■□□□ 1.96
SMKR1-201ENST00000462322 RASIP1Q5U651 963 aa27.29■■□□□ 1.96
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