RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369699.8

SORCS3-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SORCS3, Length 5,530 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3-201ENST00000369699 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.62■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.62■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 CCDC6Q16204 474 aa20.62■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.62■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 PSMB7Q99436 277 aa20.62■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 WDR64B1ANS9 1081 aa20.62■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 MAN2A1Q16706 1144 aa20.62■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.62■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 PRELPP51888 382 aa20.62■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.62■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 K7ERI5 159 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 MED7O43513 233 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 A6NJR5 290 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 ITPK1Q13572 414 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 ZNF233A6NK53 670 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 SETDB1Q15047 1291 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 THAP12O43422 761 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 SMIM5Q71RC9 77 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 FAM20AQ96MK3 541 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 NLRP4Q96MN2 994 aa20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 CLIC2O15247 247 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 TECPR2O15040 1411 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 NTSR2O95665 410 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 SLC12A2P55011 1212 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 MTMR3Q13615 1198 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 NEK9Q8TD19 979 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 ZBTB9Q96C00 473 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 SFNP31947 248 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 ENTPD3O75355 529 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 CARD6Q9BX69 1037 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 CSF1RP07333 972 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 STAT3P40763 770 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 PSMC4P43686 418 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 RESTQ13127 1097 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 NBPF11Q86T75 865 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 AIFM3Q96NN9 605 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 LY9Q9HBG7 655 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 VPS18Q9P253 973 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 ASB14A6NK59 587 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 NMT2O60551 498 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 CPS1P31327 1500 aa20.59■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 KCNK3O14649 394 aa20.58■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 IKBKBO14920 756 aa20.58■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.58■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 ITKQ08881 620 aa20.58■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.58■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.58■□□□□ 0.89
SORCS3-201ENST00000369699 CCNE1P24864 410 aa20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 NME8Q8N427 588 aa20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 LARGE1O95461 756 aa20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 CDC25AP30304 524 aa20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 TNFAIP2Q03169 654 aa20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 C12orf60Q5U649 245 aa20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 FYB2Q5VWT5 728 aa20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 BBS5Q8N3I7 341 aa20.58■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 IFNB1P01574 187 aa20.57■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.57■□□□□ 0.88
SORCS3-201ENST00000369699 PHKA2P46019 1235 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms