RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 SCRN1Q12765 414 aa29.08■■■□□ 2.25
CTXN1-201ENST00000318978 C9orf50Q5SZB4 431 aa29.08■■■□□ 2.25
CTXN1-201ENST00000318978 MCTP2Q6DN12 878 aa29.08■■■□□ 2.25
CTXN1-201ENST00000318978 MXRA8Q9BRK3 442 aa29.08■■■□□ 2.25
CTXN1-201ENST00000318978 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CTXN1-201ENST00000318978 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 MAFGO15525 162 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 ATP9AO75110 1047 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 DEXIO95424 95 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 CSF2RAP15509 400 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 SREBF1P36956 1147 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 EPHB4P54760 987 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 CCL23P55773 120 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 NLRP5P59047 1200 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 PTGISQ16647 500 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 LRIT3Q3SXY7 679 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 C8orf34Q49A92 452 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 UMODL1Q5DID0 1318 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 SH3GLB2Q9NR46 395 aa29.07■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 KCNA2P16389 499 aa29.06■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGAP4P98171 946 aa29.06■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 IL17RAQ96F46 866 aa29.06■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 LRCH3Q96II8 777 aa29.06■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 GPR20Q99678 358 aa29.06■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 HDAC6Q9UBN7 1215 aa29.06■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 PFKFB2O60825 505 aa29.05■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 LGALS2P05162 132 aa29.05■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 SESTD1Q86VW0 696 aa29.05■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 C16orf70Q9BSU1 422 aa29.05■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 H3BRB1 525 aa29.04■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 ADAMTS3O15072 1205 aa29.04■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 CEP55Q53EZ4 464 aa29.04■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 CYP2W1Q8TAV3 490 aa29.04■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 RASGRP4Q8TDF6 673 aa29.04■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 KCNH7Q9NS40 1196 aa29.04■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa29.04■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 HAS3O00219 553 aa29.03■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 RETREG2Q8NC44 543 aa29.03■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 SDF4Q9BRK5 362 aa29.03■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 ACRP10323 421 aa29.02■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC155Q8N6L0 562 aa29.02■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 SCLYQ96I15 445 aa29.02■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 WNT8AQ9H1J5 351 aa29.02■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 TELO2Q9Y4R8 837 aa29.02■■■□□ 2.24
CTXN1-201ENST00000318978 ARP10275 920 aa29.01■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 BFSP2Q13515 415 aa29.01■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 AIFM3Q96NN9 605 aa29.01■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP29.01■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 IL23AQ9NPF7 189 aa29.01■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 PLA2G4DQ86XP0 818 aa29■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 TRIM50Q86XT4 487 aa29■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 NECAB1Q8N987 351 aa29■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 SEPT1Q8WYJ6 367 aa29■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 MEIS1O00470 390 aa28.99■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 ME3Q16798 604 aa28.99■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.99■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.99■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.99■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 SCN5AQ14524 2016 aa28.99■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 KAT6AQ92794 2004 aa28.99■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 DTNBO60941 627 aa28.98■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 CYP3A4P08684 503 aa28.98■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 XBP1P17861 261 aa28.98■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM240Q5SV17 173 aa28.98■■■□□ 2.23
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CTXN1-201ENST00000318978 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.98■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 STK36Q9NRP7 1315 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 FAM86B1E9PN63 330 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 PITPNM1O00562 1244 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 LARGE1O95461 756 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 FAM86B2P0C5J1 330 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 BLIDQ8IZY5 108 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 CAGE1Q8TC20 777 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 GLG1Q92896 1179 aa28.97■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 NFASCO94856 1347 aa28.96■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.96■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 FGBP02675 491 aa28.96■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 WASF1Q92558 559 aa28.96■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 GTF3C6Q969F1 213 aa28.96■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 UIMC1Q96RL1 719 aa28.96■■■□□ 2.23
CTXN1-201ENST00000318978 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
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