RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 GALNT17Q6IS24 598 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 BLIDQ8IZY5 108 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 WASF1Q92558 559 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 TBX21Q9UL17 535 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 FAM86B1E9PN63 330 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 MEIS1O00470 390 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 GPR20Q99678 358 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 ALG1Q9BT22 464 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 B4GALT4O60513 344 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 ARP10275 920 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 XBP1P17861 261 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF76P36508 570 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 IL27Q8NEV9 243 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 ST18O60284 1047 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 ITGB8P26012 769 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 HAS3O00219 553 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 EDIL3O43854 480 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 LGALS2P05162 132 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 CIITAP33076 1130 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 PSEN2P49810 448 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 SP4Q02446 784 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-201ENST00000301730 RAG1P15918 1043 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 BMP8BP34820 402 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 CHMP4BP1P59074 171 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 MFSD10Q14728 455 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 SESTD1Q86VW0 696 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 TBCKQ8TEA7 893 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 BADQ92934 168 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 NFASCO94856 1347 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 TIMP1P01033 207 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 USP11P51784 963 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 TRIM50Q86XT4 487 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 OXER1Q8TDS5 423 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 LENG9Q96B70 501 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 SDF4Q9BRK5 362 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 H3BRB1 525 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.351e-7■■□□□ 11.9
RNPS1-201ENST00000301730 PRR16Q569H4 304 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 C7orf31Q8N865 590 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.47■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 HIPK3Q9H422 1215 aa23.47■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.46■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 A0A1W2PPC1 479 aa23.46■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 MMP1P03956 469 aa23.46■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 CYP2C9P11712 490 aa23.46■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 KRT2P35908 639 aa23.46■■□□□ 1.35
RNPS1-201ENST00000301730 FOSBP53539 338 aa23.46■■□□□ 1.35
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