RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299572.9

CENPN-201, Transcript of centromere protein N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPN, Length 1,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPN-201ENST00000299572 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.46■■□□□ 1.35
CENPN-201ENST00000299572 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 H3BRB1 525 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 MEIS2O14770 477 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 NBNO60934 754 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 LGALS2P05162 132 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 HIC1Q14526 733 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 KRT32Q14532 448 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 METTL7BQ6UX53 244 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 WNT8BQ93098 351 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 THEGQ9P2T0 379 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 SEMA3FQ13275 785 aa23.44■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.44■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.44■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 SERINC5Q86VE9 423 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 NEK1Q96PY6 1258 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 CERS4Q9HA82 394 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.42■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 TLL1O43897 1013 aa23.42■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.42■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.42■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 TAP1Q03518 808 aa23.42■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 NLRX1Q86UT6 975 aa23.42■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.42■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.42■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 EFCAB14O75071 495 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 PSMA5P28066 241 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 HOXC8P31273 242 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 THPOP40225 353 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 ANAPC15P60006 121 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 DEFB103AP81534 67 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 MICU3Q86XE3 530 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 FANCBQ8NB91 859 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 GPR20Q99678 358 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 EMSYQ7Z589 1322 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 ARHGEF15O94989 841 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 IKBKEQ14164 716 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 MBTPS1Q14703 1052 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 TCTN1Q2MV58 587 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 EPOPA6NHQ4 379 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 RFXAPO00287 272 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 LGR5O75473 907 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 SP4Q02446 784 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 TRIM50Q86XT4 487 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 GPRASP2Q96D09 838 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPN-201ENST00000299572 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.39■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 TREHO43280 583 aa23.39■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 RSPH10BP0C881 870 aa23.39■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 CDHR1Q96JP9 859 aa23.39■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.39■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 GNAT1P11488 350 aa23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 UBE2SQ16763 222 aa23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 APOA5Q6Q788 366 aa23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 ASB2Q96Q27 587 aa23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.38■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 LCHNA4D1U4 455 aa23.37■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.37■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 CAND2O75155 1236 aa23.37■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 GJB5O95377 273 aa23.37■■□□□ 1.33
CENPN-201ENST00000299572 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms