RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000279387.11

PPP4C-201, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-201ENST00000279387 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
PPP4C-201ENST00000279387 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
PPP4C-201ENST00000279387 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.65■■■□□ 2.02
PPP4C-201ENST00000279387 KIAA0355O15063 1070 aa27.64■■■□□ 2.02
PPP4C-201ENST00000279387 METTL7BQ6UX53 244 aa27.64■■■□□ 2.02
PPP4C-201ENST00000279387 KCNH7Q9NS40 1196 aa27.64■■■□□ 2.02
PPP4C-201ENST00000279387 TBX21Q9UL17 535 aa27.64■■■□□ 2.02
PPP4C-201ENST00000279387 FDPSP14324 419 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.63■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 BICD2Q8TD16 824 aa27.63■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 GPR20Q99678 358 aa27.63■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 PCDHA4Q9UN74 947 aa27.63■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 FAM86B1E9PN63 330 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 FAM86B2P0C5J1 330 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 CYP2C9P11712 490 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 PSEN2P49810 448 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 MFSD10Q14728 455 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 NPY5RQ15761 445 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 CEP55Q53EZ4 464 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 TRIM50Q86XT4 487 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 UMODL1Q5DID0 1318 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 STK36Q9NRP7 1315 aa27.62■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 PPFIA4O75335 1185 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 CYP2C18P33260 490 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 TEX2Q8IWB9 1127 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 BLIDQ8IZY5 108 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 CRYGNQ8WXF5 182 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 CDHR1Q96JP9 859 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 SENP7Q9BQF6 1050 aa27.61■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 LGALS2P05162 132 aa27.6■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 NFRKBQ6P4R8 1299 aa27.6■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 F2P00734 622 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 PLA2G4DQ86XP0 818 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 C16orf70Q9BSU1 422 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 MEIS1O00470 390 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 TIMP1P01033 207 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 PHF20Q9BVI0 1012 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 HIPK3Q9H422 1215 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4C-201ENST00000279387 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa27.58■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 EDIL3O43854 480 aa27.58■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 CYP3A4P08684 503 aa27.58■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 BMP8BP34820 402 aa27.58■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 EPHB4P54760 987 aa27.58■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 RABEP1Q15276 862 aa27.58■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 MCTP2Q6DN12 878 aa27.58■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 C7orf31Q8N865 590 aa27.58■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 OXER1Q8TDS5 423 aa27.58■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.58■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 M0R2N6 131 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 HAS3O00219 553 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 CCL23P55773 120 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 PRR16Q569H4 304 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 TBCKQ8TEA7 893 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 NOD1Q9Y239 953 aa27.57■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.56■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 H3BRB1 525 aa27.56■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 HIC1Q14526 733 aa27.56■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 PTGISQ16647 500 aa27.56■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 DAGLBQ8NCG7 672 aa27.56■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 LAMA3Q16787 3333 aa27.56■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 MAFGO15525 162 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 XBP1P17861 261 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 C9orf50Q5SZB4 431 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 WASF1Q92558 559 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 CTAGE1Q96RT6 745 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 SDF4Q9BRK5 362 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 BACH2Q9BYV9 841 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 SLC9A2Q9UBY0 812 aa27.55■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 CSF2RAP15509 400 aa27.54■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 FPGSQ05932 587 aa27.54■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 NIPA1Q7RTP0 329 aa27.54■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 TDHQ8IZJ6 230 aa27.54■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.54■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 SCN5AQ14524 2016 aa27.54■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa27.53■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 MARK3P27448 753 aa27.53■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 SHHQ15465 462 aa27.53■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 INF2Q27J81 1249 aa27.53■■■□□ 2
PPP4C-201ENST00000279387 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms