RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.72■□□□□ 0.27
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CTIF-205ENST00000587860 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.68■□□□□ 0.26
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CTIF-205ENST00000587860 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 NHSQ6T4R5 1651 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB39O15060 712 aa16.67■□□□□ 0.26
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