RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.88■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 LCTP09848 1927 aa24.87■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 PSMC4P43686 418 aa24.87■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 FCGRTP55899 365 aa24.87■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 SP3Q02447 781 aa24.87■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 GPRASP2Q96D09 838 aa24.87■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa24.87■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.86■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 MAFGO15525 162 aa24.86■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 LIG1P18858 919 aa24.86■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 EDNRBP24530 442 aa24.86■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 TXLNAP40222 546 aa24.86■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 MAP2K5Q13163 448 aa24.86■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.86■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.86■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 CDHR1Q96JP9 859 aa24.86■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.86■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.86■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 PFKFB1P16118 471 aa24.86■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 AK8Q96MA6 479 aa24.86■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 USP49Q70CQ1 688 aa24.85■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.85■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.85■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 SLC5A5Q92911 643 aa24.85■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.85■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 ARMCX2Q7L311 632 aa24.84■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.84■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 MAML3Q96JK9 1138 aa24.84■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.84■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 PANK2Q9BZ23 570 aa24.84■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.84■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 NR1I2O75469 434 aa24.83■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.83■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.83■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 CTGFP29279 349 aa24.83■■□□□ 1.57
PSPC1-204ENST00000492741 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
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PSPC1-204ENST00000492741 MORC4Q8TE76 937 aa24.82■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 TRIM47Q96LD4 638 aa24.82■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.81■■□□□ 1.56
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PSPC1-204ENST00000492741 CABP7Q86V35 215 aa24.81■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 SDF4Q9BRK5 362 aa24.81■■□□□ 1.56
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PSPC1-204ENST00000492741 HPSEQ9Y251 543 aa24.81■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 GPR25O00155 361 aa24.81■■□□□ 1.56
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PSPC1-204ENST00000492741 ZNF202O95125 648 aa24.81■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.81■■□□□ 1.56
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PSPC1-204ENST00000492741 TINF2Q9BSI4 451 aa24.81■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.81■■□□□ 1.56
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PSPC1-204ENST00000492741 ICAM3P32942 547 aa24.8■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 SEMA3FQ13275 785 aa24.8■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.8■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PSPC1-204ENST00000492741 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.8■■□□□ 1.56
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