RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAPS2Q9BXY5 557 aa18.11■□□□□ 0.49
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MED4Q9NPJ6 270 aa18.09■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MFAP3LO75121 409 aa18.08■□□□□ 0.49
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMC4Q7Z404 712 aa18.08■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.08■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.08■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDLIM2Q96JY6 352 aa18.08■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF11P52732 1056 aa18.08■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SARM1Q6SZW1 724 aa18.08■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.08■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEX33O43247 280 aa18.08■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 THAP12O43422 761 aa18.08■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAT2P52630 851 aa18.08■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.08■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NT5C1BQ96P26 610 aa18.08■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AS3MTQ9HBK9 375 aa18.08■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB20Q9NX57 234 aa18.08■□□□□ 0.48
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