RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0753Q2KHM9 967 aa30.27■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa30.27■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPZ1Q9BXG8 430 aa30.27■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO9BQ13459 2157 aa30.27■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAS3O00219 553 aa30.26■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SP2Q02086 613 aa30.26■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSDL1Q3SXM5 330 aa30.26■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFXL1Q6ZNB6 911 aa30.26■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMTC2Q8N394 836 aa30.26■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC9A7Q96T83 725 aa30.26■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SELPP16109 830 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRE1Q14246 886 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC8DQ7L1W4 858 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPM1EQ8WY54 764 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM87BQ96K49 555 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LZTS2Q9BRK4 669 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLXIPQ9HAP2 919 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHD7Q9P2D1 2997 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRMPD4Q14CM0 1322 aa30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC69A6NI79 296 aa30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC27A2O14975 620 aa30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGFBP4P22692 258 aa30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMARCA1P28370 1054 aa30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBL2Q08999 1139 aa30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNPTABQ3T906 1256 aa30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAM2O75886 525 aa30.23■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAIAP3O94812 1187 aa30.23■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNAQP50148 359 aa30.23■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VCANP13611 3396 aa30.23■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARNO95453 639 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CKBP12277 381 aa30.22■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTK7Q13308 1070 aa30.22■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CREB3L3Q68CJ9 461 aa30.22■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CUL5Q93034 780 aa30.22■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANO2Q9NQ90 1003 aa30.22■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TET1Q8NFU7 2136 aa30.22■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CA3P07451 260 aa30.21■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa30.21■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHA8P1O95397 391 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALM1P0DP23 149 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALM2P0DP24 149 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALM3P0DP25 149 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ICAM3P32942 547 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIFRP42702 1097 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNJ6P48051 423 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPNMBQ14956 572 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NECTIN1Q15223 517 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L6PQ6QN14 398 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HERC6Q8IVU3 1022 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C16orf70Q9BSU1 422 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCAS3Q9H6U6 928 aa30.19■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTEL1Q9NZ71 1219 aa30.19■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF28PB7ZC32 967 aa30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIK3CDO00329 1044 aa30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOP56O00567 594 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FIBPO43427 364 aa30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RXRAP19793 462 aa30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEDD9Q14511 834 aa30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNKSR3Q6P9H4 555 aa30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRDM6Q9NQX0 595 aa30.18■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BRB1 525 aa30.17■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEIS2O14770 477 aa30.17■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBNO60934 754 aa30.17■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXCL10P02778 98 aa30.17■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMP2KLQ5H9B9 411 aa30.17■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XRRA1Q6P2D8 792 aa30.17■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT8BQ93098 351 aa30.17■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC12A7Q9Y666 1083 aa30.17■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LGALS2P05162 132 aa30.16■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR5P61964 334 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA3FQ13275 785 aa30.16■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIC1Q14526 733 aa30.16■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF618Q5T7W0 954 aa30.16■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCNX4Q63HM2 1172 aa30.16■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL7BQ6UX53 244 aa30.16■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYFIP1Q7L576 1253 aa30.16■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC2Q9BYS8 371 aa30.16■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRANK1O15050 2925 aa30.15■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TJAP1Q5JTD0 557 aa30.15■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
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