RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452612.5

TTC28-AS1-217, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 746 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ASB2Q96Q27 587 aa15.06■□□□□ 0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RIOX1Q9H6W3 641 aa15.06■□□□□ 0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TTC28Q96AY4 2481 aa15.05■□□□□ 0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KIF28PB7ZC32 967 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HAS3O00219 553 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NBNO60934 754 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BAIAP3O94812 1187 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 F2P00734 622 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 POLR2MP0CAP2 368 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CKBP12277 381 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SP2Q02086 613 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TAP1Q03518 808 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KRT40Q6A162 431 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SPRED2Q7Z698 418 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NCOA7Q8NI08 942 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 WNT8BQ93098 351 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SPATA33Q96N06 139 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MICAL3Q7RTP6 2002 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TNFRSF10AO00220 468 aa15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TLL1O43897 1013 aa15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCND2P30279 289 aa15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DEFB103AP81534 67 aa15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TROAPQ12815 778 aa15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HIC1Q14526 733 aa15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TCTN1Q2MV58 587 aa15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MTCH2Q9Y6C9 303 aa15.04■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LCHNA4D1U4 455 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SGSM2O43147 1006 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ANTXR2P58335 489 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TFF2Q03403 129 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RBL2Q08999 1139 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PTK7Q13308 1070 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CATIPQ7Z7H3 387 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 IL27Q8NEV9 243 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SIP14410 1827 aa15.02■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PPFIA4O75335 1185 aa15.02■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CXCL10P02778 98 aa15.02■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRAF1Q13077 416 aa15.02■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MYL10Q9BUA6 226 aa15.02■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.02■□□□□ -0
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TGFB3P10600 412 aa15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FAM117BQ6P1L5 589 aa15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 REV3LO60673 3130 aa15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MUC3AQ02505 3323 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 H3BRB1 525 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LGALS2P05162 132 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 THPOP40225 353 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GRB10Q13322 594 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MBTPS1Q14703 1052 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF654Q8IZM8 581 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MAP4K1Q92918 833 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LY9Q9HBG7 655 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MTUS1Q9ULD2 1270 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LGR5O75473 907 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GJB5O95377 273 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KCNQ1P51787 676 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms