RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trim43aQ3TL54 445 aa24.92■■□□□ 1.58
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sumf1Q8R0F3 372 aa24.9■■□□□ 1.58
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sept14Q9DA97 430 aa24.9■■□□□ 1.58
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc2a13Q3UHK1 637 aa24.89■■□□□ 1.58
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kdm7aQ3UWM4 940 aa24.89■■□□□ 1.58
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa24.88■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Qrich1Q3UA37 777 aa24.88■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam183bQ5NC57 135 aa24.88■■□□□ 1.57
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa24.87■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lpin2Q99PI5 893 aa24.87■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vav3Q9R0C8 847 aa24.87■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp17lbE9Q9U0 468 aa24.87■■□□□ 1.57
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Armc6Q8BNU0 468 aa24.87■■□□□ 1.57
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nedd1P33215 660 aa24.86■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Senp1P59110 640 aa24.86■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hps5P59438 1126 aa24.86■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnf207Q3V3A7 635 aa24.86■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc148Q6P5U8 527 aa24.86■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 BcrQ6PAJ1 1270 aa24.86■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa24.86■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbx18Q9EPZ6 613 aa24.86■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cct5P80316 541 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbm41Q8JZV4 413 aa24.85■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Luc7lQ9CYI4 371 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc83Q9D4V3 305 aa24.85■■□□□ 1.57
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pcdha4O88689 947 aa24.85■■□□□ 1.57
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