RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638448.1

GYPB-216, Transcript of glycophorin B (MNS blood group), human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GYPB, Length 363 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYPB-216	ENST00000638448	GLDC	P23378	1020 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	GPR85	P60893	370 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	KCNA10	Q16322	511 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	OXR1	Q8N573	874 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	BRF1	Q92994	677 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	TTC1	Q99614	292 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448		H0Y8X5	98 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	ZNF205	O95201	554 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	JMJD7	P0C870	316 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	LTBR	P36941	435 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	CTSK	P43235	329 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	KCNJ6	P48051	423 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	GALK1	P51570	392 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	LINC00310	P59036	64 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	SCRN1	Q12765	414 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	FAP	Q12884	760 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	DUSP4	Q13115	394 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	NR0B2	Q15466	257 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYPB-216	ENST00000638448	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	CRTAM	O95727	393 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	EFEMP2	O95967	443 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	F2	P00734	622 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	THBD	P07204	575 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	NEK4	P51957	841 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	OCRL	Q01968	901 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	CHRNE	Q04844	493 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	ZNF460	Q14592	562 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	STAT4	Q14765	748 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	MMP19	Q99542	508 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.01	□□□□□ -1.77
GYPB-216	ENST00000638448	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.01	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms