RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 CEP170P1Q96L14 293 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ESPNB1AK53 854 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 STXBP3O00186 592 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TFDP1Q14186 410 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ODR4Q5SWX8 454 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CBX8Q9HC52 389 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 K7ENM7 598 aa9.18□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 ABCD1P33897 745 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 EVCP57679 992 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TTLL4Q14679 1199 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CEP55Q53EZ4 464 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 WDR44Q5JSH3 913 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 GPT2Q8TD30 523 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ATG4CQ96DT6 458 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 DRC1Q96MC2 740 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CXCL11O14625 94 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CDC25AP30304 524 aa9.17□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 DISC1Q9NRI5 854 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 MYO6Q9UM54 1294 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 GLI3P10071 1580 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 PFASO15067 1338 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 KIF4AO95239 1232 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 PLCG1P19174 1290 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 PRELPP51888 382 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ANKS1AQ92625 1134 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 YDJCA8MPS7 323 aa9.17□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 EPSTI1Q96J88 318 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 STX10O60499 249 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ICAM1P05362 532 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 PTPN14Q15678 1187 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CNGA4Q8IV77 575 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CDCA5Q96FF9 252 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 FAM167AQ96KS9 214 aa9.17□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 CTDNEP1O95476 244 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 VPS16Q9H269 839 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 VCAM1P19320 739 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 IQCEQ6IPM2 695 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC186Q7Z3E2 898 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 MEIS1O00470 390 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TDP2O95551 362 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 FANCCQ00597 558 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 POTEDQ86YR6 584 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRD-211ENST00000486161 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 RBSNQ9H1K0 784 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 C4BP0C0L5 1744 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 PPATQ06203 517 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 GPS2Q13227 327 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 MCM6Q14566 821 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 OPTNQ96CV9 577 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 POTEMA6NI47 508 aa9.15□□□□□ -0.94
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