RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475912.1

PRKD3-208, Transcript of protein kinase D3, human

TSL 3

Gene PRKD3, Length 760 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD3-208	ENST00000475912	DPF3	Q92784	378 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PRKD3-208	ENST00000475912	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PRKD3-208	ENST00000475912	BTG4	Q9NY30	223 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PRKD3-208	ENST00000475912	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.22
PRKD3-208	ENST00000475912	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PRKD3-208	ENST00000475912	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PRKD3-208	ENST00000475912	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PRKD3-208	ENST00000475912	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PRKD3-208	ENST00000475912	ADAMTS20	P59510	1910 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	FBLN1	P23142	703 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	LIMS1	P48059	325 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM129C	Q86XR2	697 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	CCDC103	Q8IW40	242 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	NETO2	Q8NC67	525 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	EPN3	Q9H201	632 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	CUL7	Q14999	1698 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	ARNTL	O00327	626 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	NTRK1	P04629	796 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	SCG5	P05408	212 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	PFKL	P17858	780 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	GFRA1	P56159	465 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	LCE4A	Q5TA78	99 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	ALG3	Q92685	438 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	KIF21B	O75037	1637 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	PTPRM	P28827	1452 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	AGRP	O00253	132 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	MC3R	P41968	323 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	GRIA2	P42262	883 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	DIO2	Q92813	273 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	PEX11G	Q96HA9	241 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912		A0A1W2PQU0	124 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	CP	P00450	1065 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	ASGR2	P07307	311 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	ATF2	P15336	505 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	FPR2	P25090	351 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	PPP2R2A	P63151	447 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	RAB33A	Q14088	237 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	VMAC	Q2NL98	169 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	IQCE	Q6IPM2	695 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	CCDC140	Q96MF4	163 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	PWWP2A	Q96N64	755 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	UACA	Q9BZF9	1416 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	C22orf46	C9J442	243 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	CAPNS1	P04632	268 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	INHBB	P09529	407 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	BMP7	P18075	431 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	PML	P29590	882 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	KCNAB2	Q13303	367 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	C1orf159	Q96HA4	380 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	RNF38	Q9H0F5	515 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	MYO1B	O43795	1136 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	NCAM1	P13591	858 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	LCP1	P13796	627 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	BCL6	P41182	706 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	FOXO4	P98177	505 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC9A5	Q14940	896 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	NLRP10	Q86W26	655 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	IER2	Q9BTL4	223 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKD3-208	ENST00000475912	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKD3-208	ENST00000475912	TRIM13	O60858	407 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKD3-208	ENST00000475912	ZBTB7A	O95365	584 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKD3-208	ENST00000475912	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRKD3-208	ENST00000475912	LTBR	P36941	435 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKD3-208	ENST00000475912	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRKD3-208	ENST00000475912	TESK1	Q15569	626 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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