RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467996.1

RNF13-208, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 767 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-208	ENST00000467996	SPATA32	Q96LK8	384 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNF13-208	ENST00000467996	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	FAM86B1	E9PN63	330 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	GPR25	O00155	361 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	BMP15	O95972	392 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	NR3C2	P08235	984 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	CYP3A7	P24462	503 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	EDNRB	P24530	442 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF76	P36508	570 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	PSMC4	P43686	418 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	STK38	Q15208	465 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	LENG9	Q96B70	501 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	SPTLC2	O15270	562 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	ITGB5	P18084	799 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	CAP1	Q01518	475 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	PTGDR	Q13258	359 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	KIF22	Q14807	665 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996		Q4G0T1	1027 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	PRR16	Q569H4	304 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	USP6NL	Q92738	828 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	ELP1	O95163	1332 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996		B4DLN1	442 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	LAD1	O00515	517 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	RGS2	P41220	211 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	PDE4D	Q08499	809 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	STXBP2	Q15833	593 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	CALCRL	Q16602	461 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	APBA2	Q99767	749 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	ASB14	A6NK59	587 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MEIS1	O00470	390 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	FKTN	O75072	461 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	PPP6R2	O75170	966 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	STAM2	O75886	525 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	RGS20	O76081	388 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	HOXC6	P09630	235 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	MTMR9	Q96QG7	549 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNF13-208	ENST00000467996	WDR81	Q562E7	1941 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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