RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 MLXIPQ9HAP2 919 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 MYH4Q9Y623 1939 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 AMPD3Q01432 767 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 LRRC55Q6ZSA7 311 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 C2CD5Q86YS7 1000 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 SLF2Q8IX21 1173 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 ERGIC2Q96RQ1 377 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 CRAMP1Q96RY5 1269 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 NDST4Q9H3R1 872 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 MMRN2Q9H8L6 949 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 RIC8AQ9NPQ8 531 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 MYH10P35580 1976 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 VWA3BQ502W6 1294 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 POLD4Q9HCU8 107 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 MYO1AQ9UBC5 1043 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 BRD3Q15059 726 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 TMEM119Q4V9L6 283 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 CERS3Q8IU89 383 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 DNAJC19Q96DA6 116 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 BCAS3Q9H6U6 928 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 L1RE1Q9UN81 338 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-202ENST00000420808 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 CYP2C19P33261 490 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 TMEM266Q2M3C6 531 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 KRT79Q5XKE5 535 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 KIAA0825Q8IV33 1275 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 NELFCDQ8IXH7 590 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 SP8Q8IXZ3 490 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 PSMB7Q99436 277 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 SALL4Q9UJQ4 1053 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 POTEB3A0JP26 581 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 LRRC53A6NM62 1247 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 POTECB2RU33 542 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 EHHADHQ08426 723 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 POTEBQ6S5H4 581 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 SLC30A10Q6XR72 485 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 COA1Q9GZY4 146 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 EHD2Q9NZN4 543 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 ATP8B1O43520 1251 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 COASYQ13057 564 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 PSTPIP2Q9H939 334 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 STK17AQ9UEE5 414 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 SAR1BQ9Y6B6 198 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 LRRC37AA6NMS7 1700 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 ZBTB5O15062 677 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 KCNMA1Q12791 1236 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 QRICH1Q2TAL8 776 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 FKBP15Q5T1M5 1219 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 RRAGAQ7L523 313 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 TMC4Q7Z404 712 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 FAM114A1Q8IWE2 563 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 SMCHD1A6NHR9 2005 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 MOCS3O95396 460 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 MYBL2P10244 700 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 C2orf54Q08AI8 447 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 CUL5Q93034 780 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 NLRC4Q9NPP4 1024 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 KIAA1024Q9UPX6 916 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 MARCH6O60337 910 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 PHACTR2O75167 634 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 EEF2P13639 858 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 KRT83P78385 493 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 JAG1P78504 1218 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 CCDC42Q96M95 316 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 NUP58Q9BVL2 599 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 TANGO6Q9C0B7 1094 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 PCDHA12Q9UN75 941 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 KRT86O43790 486 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 CXCR5P32302 372 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-202ENST00000420808 PDIA5Q14554 519 aa17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.4 ms