RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 GGA1Q9UJY5 639 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PLTPP55058 493 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PALM2Q8IXS6 379 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 FTCDO95954 541 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 NR1D1P20393 614 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CDC25AP30304 524 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SLCO1A2P46721 670 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CHRNDQ07001 517 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PPP2R5CQ13362 524 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 NLRP10Q86W26 655 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.65□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 JADE1Q6IE81 842 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 NR5A1Q13285 461 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 ST7Q9NRC1 585 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 DDAH1O94760 285 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 TPH2Q8IWU9 490 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 GPC4O75487 556 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 BBS5Q8N3I7 341 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 GSTA1P08263 222 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 GSTA2P09210 222 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 OR52Z1P0C646 297 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 LIFRP42702 1097 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.63□□□□□ -0.87
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