RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 CROCCP3Q8IVE0 287 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 DDI1Q8WTU0 396 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 YIPF3Q9GZM5 350 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CHMP2BQ9UQN3 213 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 METP08581 1390 aa5.33□□□□□ -1.56
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