RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFNKQ9P0W0 207 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA1Q5VX52 437 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SV2BQ7L1I2 683 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SULF1Q8IWU6 871 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAD54LQ92698 747 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJA10Q969M2 543 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STK24Q9Y6E0 443 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPRFP10586 1907 aa24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MSH4O15457 936 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CBFA2T2O43439 604 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBED4O75132 1171 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF76P36508 570 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPTORQ8N122 1335 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VWA5AO00534 786 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMGCS2P54868 508 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFIBO00712 420 aa24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTGS1P23219 599 aa24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OAZ1P54368 228 aa24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K9P80192 1104 aa24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ECM1Q16610 540 aa24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPXCR1Q8N123 301 aa24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VAV3Q9UKW4 847 aa24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCN4AP35499 1836 aa24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADM5C9JUS6 153 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SERPINC1P01008 464 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBASH3AP57075 661 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASIC1P78348 528 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAK1Q13153 545 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCM6Q14566 821 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP55Q53EZ4 464 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNK18Q7Z418 384 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADSSL1Q8N142 457 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERMNQ8TAM6 284 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GDAQ9Y2T3 454 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALAS1P13196 640 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DSG3P32926 999 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRCPP42785 496 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VGLL4Q14135 290 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 REPS2Q8NFH8 660 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATG4CQ96DT6 458 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYPNQ86TC9 1320 aa24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYMKA6NI61 221 aa24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R2P41236 205 aa24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOC1Q9NV70 894 aa24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEIS1O00470 390 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAT3P40763 770 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STIM1Q13586 685 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COG2Q14746 738 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms