RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	SPAG1	Q07617	926 aa		23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850		H7C1D1	291 aa		23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	PSMA7	O14818	248 aa		23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	PTPN14	Q15678	1187 aa		23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	GJA10	Q969M2	543 aa		23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	MTFR1L	Q9H019	292 aa		23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	23.03	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	MCM6	Q14566	821 aa		23.02	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	TNIP1	Q15025	636 aa		23.02	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	KRT31	Q15323	416 aa		23.02	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		23.02	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		23.02	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		23.02	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		23.02	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		23.02	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	CYP3A7	P24462	503 aa		23.02	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	CAP2	P40123	477 aa		23.02	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	23.02	■■□□□ 1.28
ME2-216	ENST00000639850	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	23.01	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	23.01	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	23.01	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	ARHGAP4	P98171	946 aa		23.01	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		23.01	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		23.01	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		23.01	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		23.01	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	SHTN1	A0MZ66	631 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	KCNJ18	B7U540	433 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	MMP14	P50281	582 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	KCNJ12	Q14500	433 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	TC2N	Q8N9U0	490 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	RAD54L	Q92698	747 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	CEP135	Q66GS9	1140 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	CCDC125	Q86Z20	511 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	MBOAT7	Q96N66	472 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	SH2D4A	Q9H788	454 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		23	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	NFKBIE	O00221	500 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	N4BP3	O15049	544 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	PBX1	P40424	430 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	STK4	Q13043	487 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	TRAF1	Q13077	416 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	VCPKMT	Q9H867	229 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	MYMK	A6NI61	221 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	TRIM47	Q96LD4	638 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	UIMC1	Q96RL1	719 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	VPS16	Q9H269	839 aa		22.99	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	OPLAH	O14841	1288 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	FCER1A	P12319	257 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	PPP1R2	P41236	205 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	TMEM139	Q8IV31	216 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	SREBF1	P36956	1147 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	MAP3K10	Q02779	954 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	ECM1	Q16610	540 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	KCNK18	Q7Z418	384 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		22.98	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	ARHGAP6	O43182	974 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	ASNS	P08243	561 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	RASA3	Q14644	834 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	PRR16	Q569H4	304 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	UNC13D	Q70J99	1090 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	DYM	Q7RTS9	669 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	ZNF592	Q92610	1267 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	KIFC2	Q96AC6	838 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	THAP9	Q9H5L6	903 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	BCS1L	Q9Y276	419 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		22.97	■■□□□ 1.27
ME2-216	ENST00000639850	BICDL2	A1A5D9	508 aa		22.97	■■□□□ 1.27

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