RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANO1Q5XXA6 986 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 KATNBL1Q9H079 304 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 PXMP2Q9NR77 195 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIK3CDO00329 1044 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEPT4O43236 478 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 SGPL1O95470 568 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJA8P48165 433 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDE4DQ08499 809 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 ST3GAL1Q11201 340 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBE2SQ16763 222 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMCO2A6NFE2 343 aa24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 DEXIO95424 95 aa24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 EDNRBP24530 442 aa24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 LHX8Q68G74 356 aa24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADCY7P51828 1080 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHISA4Q96DD7 197 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 AIFM3Q96NN9 605 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 B4DLN1 442 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 IWS1Q96ST2 819 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 NR3C2P08235 984 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL31RAQ8NI17 732 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 AKR1A1P14550 325 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 PGM5Q15124 567 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL27Q8NEV9 243 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 VTA1Q9NP79 307 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK36Q9NRP7 1315 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAMTS3O15072 1205 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADCY6O43306 1168 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 JAK2O60674 1132 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 MSCO60682 206 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 STXBP2Q15833 593 aa24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 C6orf50Q9HD87 102 aa24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM260Q9NX78 707 aa24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.04■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 ESYT2A0FGR8 921 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 RARBP10826 455 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 PGBD1Q96JS3 809 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTGS1P23219 599 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCND2P30279 289 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 NLRP5P59047 1200 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNFAIP2Q03169 654 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMX3Q96JJ7 454 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMPD1P17405 629 aa24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNA11P29992 359 aa24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCM2P49736 904 aa24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 PGK1P00558 417 aa24■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 TEX2Q8IWB9 1127 aa24■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALG1Q9BT22 464 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms