RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 RIPK1Q13546 671 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 KRT71Q3SY84 523 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 RUBCNQ92622 972 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 CNKSR1Q969H4 720 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 COPRSQ9NQ92 184 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 MREGQ8N565 214 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 MTMR8Q96EF0 704 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SELENOSQ9BQE4 189 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SMIM23A6NLE4 172 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 H0YGN5 161 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 KIF5BP33176 963 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 RNF220Q5VTB9 566 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 PNMA2Q9UL42 364 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 NFS1Q9Y697 457 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 LRRD1A4D1F6 860 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 STXBP3O00186 592 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 IFNAR2P48551 515 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SYT15Q9BQS2 421 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 COQ9O75208 318 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ERVK-9P63128 1117 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ANO7Q6IWH7 933 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 C14orf37Q86TY3 774 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 WHAMMQ8TF30 809 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 RASSF7Q02833 373 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 MTRQ99707 1265 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ECT2Q9H8V3 914 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.45■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 AKR1B10O60218 316 aa20.45■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 CCND1P24385 295 aa20.45■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 PCK1P35558 622 aa20.45■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 GCKRQ14397 625 aa20.45■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 SLMAPQ14BN4 828 aa20.45■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.45■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.45■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 TRIM4Q9C037 500 aa20.45■□□□□ 0.87
PACS1-205ENST00000527224 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 NCALDP61601 193 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 LONP2Q86WA8 852 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 P3H4Q92791 437 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 LRRC37A3O60309 1634 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 KIF11P52732 1056 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 TRIM47Q96LD4 638 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 CPDO75976 1380 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 MMEP08473 750 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 ZNF174Q15697 407 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 KLHL29Q96CT2 875 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 CHN1P15882 459 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 PI16Q6UXB8 463 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PACS1-205ENST00000527224 OCEL1Q9H607 264 aa20.44■□□□□ 0.86
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