RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 CTAGE4Q8IX94 777 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 ADGRF4Q8IZF3 695 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 LACRTQ9GZZ8 138 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 HDAC6Q9UBN7 1215 aa17.38■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 MAP2K7O14733 419 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 RHOXF2BP0C7M4 288 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SLURP2P0DP57 97 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 PDIA5Q14554 519 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SP8Q8IXZ3 490 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SEPT12Q8IYM1 358 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 RHOXF2Q9BQY4 288 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 TTLL1O95922 423 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SHMT1P34896 483 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 TNNI2P48788 182 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 RAD54LQ92698 747 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 COA1Q9GZY4 146 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 RIC8AQ9NPQ8 531 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SERPINB13Q9UIV8 391 aa17.37■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 FOCADQ5VW36 1801 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 POTEB2H3BUK9 544 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 OAS2P29728 719 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM193AP78312 1265 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 KRT83P78385 493 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 ECM1Q16610 540 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 TMEM266Q2M3C6 531 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF662Q6ZS27 426 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 GJA10Q969M2 543 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 USP40Q9NVE5 1235 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 LTBP1Q14766 1721 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SLC16A2P36021 539 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SCNN1DP51172 638 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 TUBB4BP68371 445 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 FIGNQ5HY92 759 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 GLIS3Q8NEA6 775 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SNX29Q8TEQ0 813 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 HAS1Q92839 578 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 ABCB6Q9NP58 842 aa17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 A0A1W2PQJ5 194 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 EPHB6O15197 1021 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 VSNL1P62760 191 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 CYP27A1Q02318 531 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 TMEM119Q4V9L6 283 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 JAKMIP2Q96AA8 810 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 DUSP10Q9Y6W6 482 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF263O14978 683 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 EHHADHQ08426 723 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 VWA3BQ502W6 1294 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 FKBP15Q5T1M5 1219 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 PPP4R3AQ6IN85 833 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 KIAA1328Q86T90 577 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC170Q8IYT3 715 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 DDX12PQ92771 950 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SUGCTQ9HAC7 445 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SIK3Q9Y2K2 1263 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa17.35■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 USP17L10C9JJH3 530 aa17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SRGAP2O75044 1071 aa17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 IDEP14735 1019 aa17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 CDK17Q00537 523 aa17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 KRT79Q5XKE5 535 aa17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 NDST4Q9H3R1 872 aa17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 L1RE1Q9UN81 338 aa17.34■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 CYP2C19P33261 490 aa17.33■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 LRRC41Q15345 812 aa17.33■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 DOK7Q18PE1 504 aa17.33■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 PPP1R18Q6NYC8 613 aa17.33■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 KCTD1Q719H9 257 aa17.33■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 RAB34Q9BZG1 259 aa17.33■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 SWAP70Q9UH65 585 aa17.33■□□□□ 0.37
ANKRD54-210ENST00000498417 H3BQF6 201 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-210ENST00000498417 KRT86O43790 486 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-210ENST00000498417 MMS19Q96T76 1030 aa17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-210ENST00000498417 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-210ENST00000498417 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-210ENST00000498417 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
ANKRD54-210ENST00000498417 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
ANKRD54-210ENST00000498417 ATP2B2Q01814 1243 aa17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms