RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485989.6

TACC3-210, Transcript of transforming acidic coiled-coil containing protein 3, human

TSL 3

Gene TACC3, Length 726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TACC3-210	ENST00000485989	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	ARIH2	O95376	493 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	CALM1	P0DP23	149 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	CALM2	P0DP24	149 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	CALM3	P0DP25	149 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	GNAQ	P50148	359 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	FGD1	P98174	961 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	TLE2	Q04725	743 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	PPP2R5B	Q15173	497 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989		Q6ZUG5	572 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	FANCB	Q8NB91	859 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	IL31RA	Q8NI17	732 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	KCNB2	Q92953	911 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	PRO3102	Q9H379	93 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	PXMP2	Q9NR77	195 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	ZBTB43	O43298	467 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	POLR2M	P0CAP2	368 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	APOBR	Q0VD83	1088 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	RTN1	Q16799	776 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	GDF15	Q99988	308 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989		B4DLN1	442 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	SORBS3	O60504	671 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	NR3C2	P08235	984 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	RPS6KB1	P23443	525 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	PSMC6	P62333	389 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	LTBP2	Q14767	1821 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	LY6K	Q17RY6	165 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	SCFD2	Q8WU76	684 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	BRF1	Q92994	677 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	MYL3	P08590	195 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	CLTB	P09497	229 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	CDC27	P30260	824 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	NKX3-2	P78367	333 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	GHRHR	Q02643	423 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	TRAF1	Q13077	416 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	TTLL4	Q14679	1199 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	PGM5	Q15124	567 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	STXBP2	Q15833	593 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989		Q9Y3F1	56 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	ELP1	O95163	1332 aa		14.77	□□□□□ -0.04
TACC3-210	ENST00000485989	ZEB2	O60315	1214 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	ITGB8	P26012	769 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	SMARCA1	P28370	1054 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	UBE2S	Q16763	222 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	BAD	Q92934	168 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	IWS1	Q96ST2	819 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	USP26	Q9BXU7	913 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	MAF1	Q9H063	256 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	ARVCF	O00192	962 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	PPFIA3	O75145	1194 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	CCND2	P30279	289 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	FAAP100	Q0VG06	881 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	CUL5	Q93034	780 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05

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