RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CB-208	ENST00000455580	CYTH3	O43739	400 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	CFB	P00751	764 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	HSD17B4	P51659	736 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	PPP2R5B	Q15173	497 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	PRC1	O43663	620 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	MCM5	P33992	734 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	CPT1A	P50416	773 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	EPHB4	P54760	987 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	FPGS	Q05932	587 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	TRAF1	Q13077	416 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	TTLL4	Q14679	1199 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	CASC1	Q6TDU7	716 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	HOMER1	Q86YM7	354 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAP3K14	Q99558	947 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYH6	P13533	1939 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	PSMC6	P62333	389 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	STXBP2	Q15833	593 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMTC2	Q8N394	836 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	COPS5	Q92905	334 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARIH2	O95376	493 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	MFSD5	Q6N075	450 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	DEFB123	Q8N688	67 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMEM87B	Q96K49	555 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	PXMP2	Q9NR77	195 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580		A6NJR5	290 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	DDAH1	O94760	285 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	NR3C2	P08235	984 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580		Q7L0L9	218 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYL3	P08590	195 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	KPNA6	O60684	536 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	SMARCA1	P28370	1054 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	LIFR	P42702	1097 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYL10	Q9BUA6	226 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIF5B	P33176	963 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	LY6K	Q17RY6	165 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCDC69	A6NI79	296 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	B4GALT4	O60513	344 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	POLR2M	P0CAP2	368 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	RNF20	Q5VTR2	975 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMEM199	Q8N511	208 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	CDC45	O75419	566 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	GH1	P01241	217 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	CYP2C18	P33260	490 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	CSF2RA	P15509	400 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	GNAQ	P50148	359 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARHGAP1	Q07960	439 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	HIPK3	Q9H422	1215 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	CALM1	P0DP23	149 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	CALM2	P0DP24	149 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	CALM3	P0DP25	149 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	PGM5	Q15124	567 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	AFG1L	Q8WV93	481 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	27.78	■■■□□ 2.04	4e-9	■■□□□ 12.7
PPP1CB-208	ENST00000455580	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CB-208	ENST00000455580	RGS20	O76081	388 aa		27.77	■■■□□ 2.04

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