RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 USP11P51784 963 aa24.96■■□□□ 1.59
VSX1-205ENST00000429762 NLRP12P59046 1061 aa24.96■■□□□ 1.59
VSX1-205ENST00000429762 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.96■■□□□ 1.59
VSX1-205ENST00000429762 CABP7Q86V35 215 aa24.96■■□□□ 1.59
VSX1-205ENST00000429762 LRRC15Q8TF66 581 aa24.96■■□□□ 1.59
VSX1-205ENST00000429762 MARCH6O60337 910 aa24.95■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 PRR16Q569H4 304 aa24.95■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 IQUBQ8NA54 791 aa24.95■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 DISC1Q9NRI5 854 aa24.95■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 FAM86B1E9PN63 330 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 STAT6P42226 847 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 TREML2Q5T2D2 321 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 DSG3P32926 999 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 PLCB2Q00722 1185 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 UVSSAQ2YD98 709 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 MCTP2Q6DN12 878 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 MTRQ99707 1265 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 BLZF1Q9H2G9 400 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 COL20A1Q9P218 1284 aa24.94■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 AP5Z1O43299 807 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 CYP3A7P24462 503 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 KANK3Q6NY19 840 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 MBOAT7Q96N66 472 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 RIPK3Q9Y572 518 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 IRF6O14896 467 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 IQCB1Q15051 598 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 SMARCE1Q969G3 411 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 AK8Q96MA6 479 aa24.93■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 PLCG1P19174 1290 aa24.92■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 REPS2Q8NFH8 660 aa24.92■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 LENG9Q96B70 501 aa24.92■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 RRAGCQ9HB90 399 aa24.92■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 PEX10O60683 326 aa24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 BMP6P22004 513 aa24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 ZNF76P36508 570 aa24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 COG2Q14746 738 aa24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 HSD17B4P51659 736 aa24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.91■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 STAT3P40763 770 aa24.9■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.9■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.9■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.9■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 DPYDQ12882 1025 aa24.89■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 CUL4BQ13620 913 aa24.89■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 Q4G0T1 1027 aa24.89■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 ERO1BQ86YB8 467 aa24.89■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.89■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 RNF146Q9NTX7 359 aa24.89■■□□□ 1.58
VSX1-205ENST00000429762 CYP3A4P08684 503 aa24.89■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 CIITAP33076 1130 aa24.89■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.89■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.89■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 PNMA5Q96PV4 448 aa24.89■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.89■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.89■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.88■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 PPATQ06203 517 aa24.88■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 GRB10Q13322 594 aa24.88■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 PLS1Q14651 629 aa24.88■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.88■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 NSMFQ6X4W1 530 aa24.88■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.88■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 OPTNQ96CV9 577 aa24.88■■□□□ 1.57
VSX1-205ENST00000429762 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms