RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219473.11

USP10-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP10, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-201ENST00000219473 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 TADA3O75528 432 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 ECM1Q16610 540 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 RAB34Q9BZG1 259 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 TBC1D7Q9P0N9 293 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 TRIM10Q9UDY6 481 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 FAM198AQ9UFP1 575 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 H0YIN7 160 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 CLCN6P51797 869 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 MAP3K9P80192 1104 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 SLFN13Q68D06 897 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 CCDC51Q96ER9 411 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 MRFAP1Q9Y605 127 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 LTBP1Q14766 1721 aa16.68■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 SLC35F6Q8N357 371 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 FEZ1Q99689 392 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 BICDL2A1A5D9 508 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 DDX12PQ92771 950 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 ZDHHC15Q96MV8 337 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 SEMA6BQ9H3T3 888 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 OGFRQ9NZT2 677 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 ICA1Q05084 483 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 OR8K1Q8NGG5 319 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 HAS1Q92839 578 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 ZBTB9Q96C00 473 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.67■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.261e-6■■■□□ 16.3
USP10-201ENST00000219473 TRIM14Q14142 442 aa16.66■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.66■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 LRRC37AA6NMS7 1700 aa16.66■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 DACT2Q5SW24 774 aa16.66■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 MYH4Q9Y623 1939 aa16.66■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 EFCAB8A8MWE9 144 aa16.65■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 STAT3P40763 770 aa16.65■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 DNM2P50570 870 aa16.65■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 RAD54LQ92698 747 aa16.65■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 CCDC17Q96LX7 622 aa16.65■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 ZHX3Q9H4I2 956 aa16.65■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 FOCADQ5VW36 1801 aa16.65■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 STRIP1Q5VSL9 837 aa16.65■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 E9PMD0 336 aa16.64■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 NDUFA10O95299 355 aa16.64■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.64■□□□□ 0.26
USP10-201ENST00000219473 UNC13DQ70J99 1090 aa16.64■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 STK17AQ9UEE5 414 aa16.64■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.64■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.64■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 F5H6K3 240 aa16.64■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 GH2P01242 217 aa16.64■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 KLRC3Q07444 240 aa16.64■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 ST7Q9NRC1 585 aa16.64■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 MYH7BA7E2Y1 1941 aa16.64■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 POTEB3A0JP26 581 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 CTAGE9A4FU28 777 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 POTECB2RU33 542 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 PLSCR1O15162 318 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 JAG1P78504 1218 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 ABCB5Q2M3G0 1257 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 PPP4R3AQ6IN85 833 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 WDR59Q6PJI9 974 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 POTEBQ6S5H4 581 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 SIAH1Q8IUQ4 282 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 ZMYND15Q9H091 742 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 SCN9AQ15858 1988 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 CLRN2A0PK11 232 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 PDIA5Q14554 519 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 PRR16Q569H4 304 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 FAM114A1Q8IWE2 563 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 ANO3Q9BYT9 981 aa16.63■□□□□ 0.25
USP10-201ENST00000219473 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms