RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 CLIP2Q9UDT6 1046 aa27.49■■□□□ 1.99
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CAPNS1-214ENST00000592483 A0A0G2JMZ2 1700 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 MOXD2PA6NHM9 499 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 AKR1A1P14550 325 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 MCM2P49736 904 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 RCAN1P53805 252 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 TCEANC2Q96MN5 208 aa27.48■■□□□ 1.99
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CAPNS1-214ENST00000592483 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-214ENST00000592483 TFF2Q03403 129 aa27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-214ENST00000592483 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-214ENST00000592483 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 NFXL1Q6ZNB6 911 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa27.46■■□□□ 1.99
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CAPNS1-214ENST00000592483 HERVK_113Q902F9 699 aa27.46■■□□□ 1.99
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CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PRG0 241 aa27.45■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 SLC25A27O95847 323 aa27.45■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 CDK7P50613 346 aa27.45■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC10AQ8IUN9 316 aa27.45■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 BRF1Q92994 677 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC12A7Q9Y666 1083 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-214ENST00000592483 MYH4Q9Y623 1939 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-214ENST00000592483 AK2P54819 239 aa27.44■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 MICALL1Q8N3F8 863 aa27.41■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 APOBRQ0VD83 1088 aa27.4■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB43O43298 467 aa27.39■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 SNHG28P0DPA3 235 aa27.39■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
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CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-214ENST00000592483 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-214ENST00000592483 ARVCFO00192 962 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFB10O96000 172 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 CST5P28325 142 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF5BP33176 963 aa27.38■■□□□ 1.97
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