RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.86■□□□□ 0.29
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CTIF-205ENST00000587860 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 IDEP14735 1019 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 PDE4DQ08499 809 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 CCDC96Q2M329 555 aa16.86■□□□□ 0.29
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CTIF-205ENST00000587860 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.84■□□□□ 0.29
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CTIF-205ENST00000587860 USP17L18D6R9N7 530 aa16.84■□□□□ 0.29
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CTIF-205ENST00000587860 BBOX1O75936 387 aa16.81■□□□□ 0.28
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CTIF-205ENST00000587860 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.81■□□□□ 0.28
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CTIF-205ENST00000587860 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.81■□□□□ 0.28
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CTIF-205ENST00000587860 OAS2P29728 719 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CTIF-205ENST00000587860 KCNJ6P48051 423 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-205ENST00000587860 PPP2R5AQ15172 486 aa16.8■□□□□ 0.28
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