RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584377.5

CSNK1D-222, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 2,891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-222	ENST00000584377	POTED	Q86YR6	584 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	EPC1	Q9H2F5	836 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	MYH1	P12882	1939 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377		F8W031	263 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	RIMBP2	O15034	1052 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	ATP8B1	O43520	1251 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1W2PQC6	194 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	TTC26	A0AVF1	554 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	PSEN1	P49768	467 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	AMPD3	Q01432	767 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	CALML4	Q96GE6	196 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	SASH3	O75995	380 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	AKR1B1	P15121	316 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	TXK	P42681	527 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	GABPA	Q06546	454 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	STK4	Q13043	487 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	GOLGA1	Q92805	767 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	P2RX5	Q93086	422 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	COA7	Q96BR5	231 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	MYH8	P13535	1937 aa		14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	BICDL2	A1A5D9	508 aa		14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	TBC1D8	O95759	1140 aa		14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCNE1	P24864	410 aa		14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	GUCY2C	P25092	1073 aa		14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	ADCY7	P51828	1080 aa		14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	RABGGTA	Q92696	567 aa		14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	COA1	Q9GZY4	146 aa		14.77	□□□□□ -0.04
CSNK1D-222	ENST00000584377	AFF2	P51816	1311 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	CTAGE9	A4FU28	777 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	CALCRL	Q16602	461 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMC4	Q7Z404	712 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	SP8	Q8IXZ3	490 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	CHP1	Q99653	195 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377		B4DLN1	442 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	ABL1	P00519	1130 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	FCER1A	P12319	257 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	DNM2	P50570	870 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC35F6	Q8N357	371 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	CDC23	Q9UJX2	597 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	SNHG28	P0DPA3	235 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	ARHGAP25	P42331	645 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	MTMR9	Q96QG7	549 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	DNAJC7	Q99615	494 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	NDUFA10	O95299	355 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	TTLL1	O95922	423 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	PPP1R2	P41236	205 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	CHMP4BP1	P59074	171 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	CERS5	Q8N5B7	392 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC37A4	O43826	429 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	TDP2	O95551	362 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CSNK1D-222	ENST00000584377	SRGN	P10124	158 aa		14.75	□□□□□ -0.05

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