RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 RNF146Q9NTX7 359 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-210ENST00000568388 FBXO40Q9UH90 709 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-210ENST00000568388 TCHHQ07283 1943 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 KIF28PB7ZC32 967 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 ADAMTS3O15072 1205 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 TLR2O60603 784 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 BCRP11274 1271 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 HSD17B4P51659 736 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 CCNA1P78396 465 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 NR5A1Q13285 461 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 FERMT3Q86UX7 667 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 ACAD9Q9H845 621 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 NFIBO00712 420 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 PEX10O60683 326 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 POLR2MP0CAP2 368 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 C17orf99Q6UX52 265 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 TBC1D5Q92609 795 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 MROH8Q9H579 483 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 RNF186Q9NXI6 227 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 AP3B2Q13367 1082 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 CFBP00751 764 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 ERCC3P19447 782 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 UBE2SQ16763 222 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 TRPA1O75762 1119 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 CRHR2Q13324 411 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 ABHD8Q96I13 439 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM260Q9NX78 707 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 CPA4Q9UI42 421 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-210ENST00000568388 PFASO15067 1338 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 ATL3Q6DD88 541 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 LCTP09848 1927 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 PLXNB2O15031 1838 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 TRAPPC10P48553 1259 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 NSMFQ6X4W1 530 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 PORCNQ9H237 461 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 MGAMO43451 1857 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 STRNO43815 780 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 MAPK4P31152 587 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 ANO3Q9BYT9 981 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 EFCC1Q9HA90 598 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 FAM205CA6NFA0 338 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 TBCKQ8TEA7 893 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 COL20A1Q9P218 1284 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 FCER1AP12319 257 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 SREBF1P36956 1147 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 USP11P51784 963 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-210ENST00000568388 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms