RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.97□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 EHD4Q9H223 541 aa7.97□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.97□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 RLFQ13129 1914 aa7.97□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 SMIM22K7EJ46 135 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 IGSF3O75054 1194 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 HOXC6P09630 235 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 MX2P20592 715 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 CYP2C19P33261 490 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 GRB14Q14449 540 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 SEPT2Q15019 361 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 CEP85Q6P2H3 762 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 LBX2Q6XYB7 198 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 FEZ1Q99689 392 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.96□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 CYP2D6P10635 497 aa7.96□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.96□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 WDR78Q5VTH9 848 aa7.96□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.96□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.96□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 NAV1Q8NEY1 1877 aa7.96□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0G2JMZ2 1700 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 LTBP2Q14767 1821 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 COBLO75128 1261 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 CYBAP13498 195 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 CNGA1P29973 690 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 USP14P54578 494 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 RAB15P59190 212 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 PDE4DQ08499 809 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 MFSD14CQ5VZR4 134 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 ANO1Q5XXA6 986 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 TTC6Q86TZ1 520 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 AACSQ86V21 672 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 SLC44A5Q8NCS7 719 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 LPAR1Q92633 364 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 GUCD1Q96NT3 240 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF236Q9UL36 1845 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 CHGBP05060 677 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 PDE6AP16499 860 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 RTP1P59025 263 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 CCNA1P78396 465 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 ATP2B2Q01814 1243 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 MAP3K12Q12852 859 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 LCORLQ8N3X6 602 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 DYNLL2Q96FJ2 89 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 CABP5Q9NP86 173 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 CYLDQ9NQC7 956 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 DNM1LO00429 736 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 PRKAB2O43741 272 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 ERCC3P19447 782 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 ADORA2AP29274 412 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 CERS3Q8IU89 383 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 PANK1Q8TE04 598 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 FAM161BQ96MY7 647 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 SPATC1LQ9H0A9 340 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 PARP14Q460N5 1801 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa7.92□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.92□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 AKR1B1P15121 316 aa7.92□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 MAP2K3P46734 347 aa7.92□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 POU4F2Q12837 409 aa7.92□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 COG2Q14746 738 aa7.92□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 SHHQ15465 462 aa7.92□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 WDR44Q5JSH3 913 aa7.92□□□□□ -1.14
HOXD8-202ENST00000429017 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms