RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418244.5

FOXD3-AS1-201, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXD3-AS1, Length 941 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PIGSQ96S52 555 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 USP26Q9BXU7 913 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CALML3P27482 149 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GHRHRQ02643 423 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DNERQ8NFT8 737 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 APOA5Q6Q788 366 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HOMER1Q86YM7 354 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 OPLAHO14841 1288 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RXRAP19793 462 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EDNRBP24530 442 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FBXL16Q8N461 479 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FANCBQ8NB91 859 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TBC1D5Q92609 795 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 VTA1Q9NP79 307 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A0A1W2PPC1 479 aa20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADAMTS4O75173 837 aa20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PSMA5P28066 241 aa20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RCAN1P53805 252 aa20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LRRC41Q15345 812 aa20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KBTBD13C9JR72 458 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADCY6O43306 1168 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CPA1P15085 419 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RPS6KB1P23443 525 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HSD17B4P51659 736 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MICU3Q86XE3 530 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 COL20A1Q9P218 1284 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 B4DLN1 442 aa20.45■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZBTB43O43298 467 aa20.45■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NKX3-2P78367 333 aa20.45■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RNF180Q86T96 592 aa20.45■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.45■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.45■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.44■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PGK1P00558 417 aa20.44■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TNFAIP2Q03169 654 aa20.44■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.44■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 Q6ZUG5 572 aa20.44■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.44■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.44■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.44■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PHF24Q9UPV7 400 aa20.44■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EVI5O60447 810 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CFBP00751 764 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GJA9P57773 515 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FGD1P98174 961 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PDE4DQ08499 809 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RTN1Q16799 776 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NID2Q14112 1375 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms