RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 SLIT1O75093 1534 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MAPK13O15264 365 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TTC4O95801 387 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 OAS2P29728 719 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 FANCCQ00597 558 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 CMTM5Q96DZ9 223 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TESK2Q96S53 571 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 THAP9Q9H5L6 903 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 SPC25Q9HBM1 224 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 FAM169AQ9Y6X4 670 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 KIF1AQ12756 1690 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 SGSM2O43147 1006 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 NAA20P61599 178 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 HHATQ5VTY9 493 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R18Q6NYC8 613 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF710Q8N1W2 664 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 OPTNQ96CV9 577 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TEX12Q9BXU0 123 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MAPRE2Q15555 327 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 FSCBQ5H9T9 825 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 CEP85Q6P2H3 762 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 VSIG1Q86XK7 387 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 DIABLOQ9NR28 239 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MYH15Q9Y2K3 1946 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 GSTA5Q7RTV2 222 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 APPBP2Q92624 585 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 ZMYM6O95789 1325 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 RPL22P35268 128 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 LMBRD1Q9NUN5 540 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 CYP7A1P22680 504 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 CRYMQ14894 314 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 IFNKQ9P0W0 207 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 KRT10P13645 584 aa5.35□□□□□ -1.55
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