RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 DACH1Q9UI36 760 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 MED15Q96RN5 788 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 MEIS2O14770 477 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 FANCCQ00597 558 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 HACL1Q9UJ83 578 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 STAT2P52630 851 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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ACTB-201ENST00000331789 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 VCPKMTQ9H867 229 aa20.19■□□□□ 0.82
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ACTB-201ENST00000331789 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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ACTB-201ENST00000331789 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.17■□□□□ 0.82
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ACTB-201ENST00000331789 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.822e-53■■□□□ 12.2
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ACTB-201ENST00000331789 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 HAS1Q92839 578 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 KIFC2Q96AC6 838 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 CCDC174Q6PII3 467 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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ACTB-201ENST00000331789 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 SH2D4AQ9H788 454 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 SERPINC1P01008 464 aa20.15■□□□□ 0.82
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ACTB-201ENST00000331789 AP3B2Q13367 1082 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 ARID5BQ14865 1188 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.15■□□□□ 0.82
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 POTEMA6NI47 508 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-201ENST00000331789 USP11P51784 963 aa20.15■□□□□ 0.82
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ACTB-201ENST00000331789 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.15■□□□□ 0.82
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ACTB-201ENST00000331789 GRB10Q13322 594 aa20.14■□□□□ 0.81
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ACTB-201ENST00000331789 PNMA5Q96PV4 448 aa20.14■□□□□ 0.81
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ACTB-201ENST00000331789 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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ACTB-201ENST00000331789 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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ACTB-201ENST00000331789 MARCH6O60337 910 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 ZNF18P17022 549 aa20.14■□□□□ 0.81
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ACTB-201ENST00000331789 TMC6Q7Z403 805 aa20.14■□□□□ 0.81
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ACTB-201ENST00000331789 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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ACTB-201ENST00000331789 RMND1Q9NWS8 449 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 FEM1BQ9UK73 627 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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ACTB-201ENST00000331789 COBLO75128 1261 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 CYP3A7P24462 503 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 FAM160B2Q86V87 743 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D5Q92609 795 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 GDAQ9Y2T3 454 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 INPP5BP32019 993 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-201ENST00000331789 SPATA1Q5VX52 437 aa20.12■□□□□ 0.81
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