RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328379.5

PTRHD1-201, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRHD1, Length 1,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1-201ENST00000328379 CPVLQ9H3G5 476 aa20.53■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.53■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.53■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.53■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 MYADML2A6NDP7 307 aa20.52■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 KLRF2D3W0D1 207 aa20.52■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 RAG1P15918 1043 aa20.52■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 SMPD1P17405 629 aa20.52■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 TLK2Q86UE8 772 aa20.52■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 BADQ92934 168 aa20.52■□□□□ 0.88
PTRHD1-201ENST00000328379 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.52■□□□□ 0.88
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PTRHD1-201ENST00000328379 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTRHD1-201ENST00000328379 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
PTRHD1-201ENST00000328379 CTAGE5O15320 804 aa20.49■□□□□ 0.87
PTRHD1-201ENST00000328379 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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PTRHD1-201ENST00000328379 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.49■□□□□ 0.87
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PTRHD1-201ENST00000328379 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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PTRHD1-201ENST00000328379 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.47■□□□□ 0.87
PTRHD1-201ENST00000328379 CHST3Q7LGC8 479 aa20.47■□□□□ 0.87
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PTRHD1-201ENST00000328379 MCM5P33992 734 aa20.46■□□□□ 0.87
PTRHD1-201ENST00000328379 TTLL4Q14679 1199 aa20.46■□□□□ 0.87
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PTRHD1-201ENST00000328379 PPP2R5BQ15173 497 aa20.46■□□□□ 0.87
PTRHD1-201ENST00000328379 STXBP2Q15833 593 aa20.46■□□□□ 0.87
PTRHD1-201ENST00000328379 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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PTRHD1-201ENST00000328379 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.46■□□□□ 0.87
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PTRHD1-201ENST00000328379 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.46■□□□□ 0.87
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PTRHD1-201ENST00000328379 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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PTRHD1-201ENST00000328379 SHHQ15465 462 aa20.45■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.45■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.45■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 MTMR8Q96EF0 704 aa20.45■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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PTRHD1-201ENST00000328379 TROAPQ12815 778 aa20.44■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 RNF20Q5VTR2 975 aa20.44■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.44■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.44■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 TMEM87BQ96K49 555 aa20.44■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 MAP3K14Q99558 947 aa20.44■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.44■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.44■□□□□ 0.86
PTRHD1-201ENST00000328379 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.43■□□□□ 0.86
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