RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 INF2Q27J81 1249 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 MCTP2Q6DN12 878 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 CNMDO75829 334 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 TRAPPC10P48553 1259 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 GRM1Q13255 1194 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 ANO1Q5XXA6 986 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 PGBD1Q96JS3 809 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 CLIC4Q9Y696 253 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 NBR1Q14596 966 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 TBCKQ8TEA7 893 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 SPATA32Q96LK8 384 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 HSD17B4P51659 736 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 SREBF2Q12772 1141 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 TTC38Q5R3I4 469 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 ANO3Q9BYT9 981 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 ACAD9Q9H845 621 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 RASSF10A6NK89 507 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 GHRHRQ02643 423 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 Q3C1V9 767 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 NEK8Q86SG6 692 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 CHST13Q8NET6 341 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 RCOR1Q9UKL0 485 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 STK38Q15208 465 aa25.24■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 NSMFQ6X4W1 530 aa25.24■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 IFNL1Q8IU54 200 aa25.24■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.24■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.23■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 WNT7AO00755 349 aa25.23■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 YEATS4O95619 227 aa25.23■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 SLC25A27O95847 323 aa25.23■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 ERVK-9P63128 1117 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTU2-201ENST00000312060 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTU2-201ENST00000312060 FBXO40Q9UH90 709 aa25.23■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 ZNF174Q15697 407 aa25.23■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 LETM2Q2VYF4 491 aa25.23■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.23■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.23■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 ZIC5Q96T25 663 aa25.23■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 COPB2P35606 906 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 TM4SF4P48230 202 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 NOGQ13253 232 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 SLC39A14Q15043 492 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 PTPAQ15257 358 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 MAF1Q9H063 256 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 ELP1O95163 1332 aa25.21■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 ERCC3P19447 782 aa25.21■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 MCM7P33993 719 aa25.21■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.21■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 CAPNS2Q96L46 248 aa25.21■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.21■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 SPTLC2O15270 562 aa25.2■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.2■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.2■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 COL20A1Q9P218 1284 aa25.2■■□□□ 1.63
CTU2-201ENST00000312060 BMP15O95972 392 aa25.2■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 SREBF1P36956 1147 aa25.2■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 USP11P51784 963 aa25.2■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.2■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.2■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 EDIL3O43854 480 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 CCNA1P78396 465 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP4P98171 946 aa25.19■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.19■■□□□ 1.62
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