RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635519.1

NRXN1-242, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-242ENST00000635519 KIAA0754O94854 1291 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 TMCC1O94876 653 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF202O95125 648 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ALDH3A1P30838 453 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 USP46P62068 366 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 FAM209AQ5JX71 171 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 MAML3Q96JK9 1138 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 CABP1Q9NZU7 370 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 MYPNQ86TC9 1320 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 A0A0B4J203 849 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 GNAI3P08754 354 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 PMS2P54278 862 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 POLE2P56282 527 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 PLCB4Q15147 1175 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 CABP7Q86V35 215 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 C1orf74Q96LT6 269 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 CCDC69A6NI79 296 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 IDO1P14902 403 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 STAT6P42226 847 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ARHGAP25P42331 645 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 PSMC4P43686 418 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 PDE3AQ14432 1141 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 FNBP1Q96RU3 617 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 TMCO1Q9UM00 188 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.33□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM232C9JQI7 657 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 TEX28O15482 410 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 FBXO21O94952 628 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 CASP8Q14790 479 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 BRD3Q15059 726 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 DAAM2Q86T65 1068 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 RASSF10A6NK89 507 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 NUCB1Q02818 461 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 C11orf74Q86VG3 221 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 SIX5Q8N196 739 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 PDILTQ8N807 584 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 IL17RAQ96F46 866 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ASIC4Q96FT7 647 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 VCX3BQ9H321 246 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ABCB6Q9NP58 842 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 SCN7AQ01118 1682 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 RGL2O15211 777 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 SPTLC1O15269 473 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 CCDC166P0CW27 439 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 UBL4AP11441 157 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 MXRA7P84157 204 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 KLC1Q07866 573 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ADAM9Q13443 819 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ADALQ6DHV7 355 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.32□□□□□ -1.4
NRXN1-242ENST00000635519 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms