RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	LAD1	O00515	517 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	PDHB	P11177	359 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	AKR1B1	P15121	316 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	NT5C2	P49902	561 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	SCNN1D	P51172	638 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	STK4	Q13043	487 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	RHOBTB3	O94955	611 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	PRPH	P41219	470 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	SLF2	Q8IX21	1173 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM9	Q9C026	710 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152		B4DLN1	442 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	RAD21	O60216	631 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	ADRA2B	P18089	450 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	KCNB1	Q14721	858 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	CERS3	Q8IU89	383 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC51	Q96ER9	411 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	UIMC1	Q96RL1	719 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	EXOC1	Q9NV70	894 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB22	O15209	634 aa		14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	DOK7	Q18PE1	504 aa		14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35F6	Q8N357	371 aa		14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	MB21D1	Q8N884	522 aa		14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	GAK	O14976	1311 aa		14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TDP2	O95551	362 aa		14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TFR2	Q9UP52	801 aa		14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	NHS	Q6T4R5	1651 aa		14.68	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	ERCC3	P19447	782 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	KLK7	P49862	253 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TTI2	Q6NXR4	508 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	AK8	Q96MA6	479 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	AFF2	P51816	1311 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	POTEM	A6NI47	508 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	LGALS16	A8MUM7	142 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	SLC37A4	O43826	429 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	SLC16A2	P36021	539 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	DYM	Q7RTS9	669 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	CERS5	Q8N5B7	392 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	GJA10	Q969M2	543 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB9	Q96C00	473 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM37	O94972	964 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TNNI2	P48788	182 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	CALCRL	Q16602	461 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2S	Q16763	222 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	CALML4	Q96GE6	196 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		14.67	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	MYH8	P13535	1937 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	MYL1	P05976	194 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM14	Q14142	442 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	THAP9	Q9H5L6	903 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	CTAGE9	A4FU28	777 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	CHMP4BP1	P59074	171 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	MCM6	Q14566	821 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA1	Q92805	767 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	P2RX5	Q93086	422 aa		14.66	□□□□□ -0.06
BRF1-222	ENST00000635152	USP40	Q9NVE5	1235 aa		14.66	□□□□□ -0.06

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