RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ACER1Q8TDN7 264 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF2CQ99661 725 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATC1LQ9H0A9 340 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 PRC1O43663 620 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 BMP1P13497 986 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 IGFBP4P22692 258 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 COG2Q14746 738 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 RASIP1Q5U651 963 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC174Q6PII3 467 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 MAML3Q96JK9 1138 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC14Q96N46 770 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 GRXCR1A8MXD5 290 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 NOVP48745 357 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 ANTXR2P58335 489 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 DGKHQ86XP1 1220 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 MROH8Q9H579 483 aa27.58■■■□□ 2.01
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CAPNS1-214ENST00000592483 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 22e-7■□□□□ 8.5
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CAPNS1-214ENST00000592483 MFSD5Q6N075 450 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 C16orf59Q7L2K0 433 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 TMTC2Q8N394 836 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKS1AQ92625 1134 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 MTMR4Q9NYA4 1195 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 NYAP2Q9P242 653 aa27.57■■■□□ 2
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CAPNS1-214ENST00000592483 ICA1Q05084 483 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 SEPT2Q15019 361 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP95Q96GE4 821 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 SH2D4AQ9H788 454 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 IL17RBQ9NRM6 502 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 TNKSO95271 1327 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 TTLL1O95922 423 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 GUCY1A2P33402 732 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 LIFRP42702 1097 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD1Q15327 319 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM67Q5HYA8 995 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 LRFN3Q9BTN0 628 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 MSRAQ9UJ68 235 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 TBX21Q9UL17 535 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 XIRP2A4UGR9 3374 aa27.55■■■□□ 2
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CAPNS1-214ENST00000592483 RAB30Q15771 203 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 MB21D1Q8N884 522 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa27.54■■■□□ 2
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CAPNS1-214ENST00000592483 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 NEK4P51957 841 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 WTAPQ15007 396 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 SEC23AQ15436 765 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 AAK1Q2M2I8 961 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 NUP133Q8WUM0 1156 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 MKL1Q969V6 931 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 STARD7Q9NQZ5 370 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 ST18O60284 1047 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 TOP1P11387 765 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 FCER1AP12319 257 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 CHST3Q7LGC8 479 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 NCAPG2Q86XI2 1143 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 STX8Q9UNK0 236 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-214ENST00000592483 CPA1P15085 419 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 ACLYP53396 1101 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 RCSD1Q6JBY9 416 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 SGMS1Q86VZ5 419 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 TANGO6Q9C0B7 1094 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 LY9Q9HBG7 655 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 NMT2O60551 498 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAMTS4O75173 837 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 EEF2P13639 858 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 PLS1Q14651 629 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 Q6ZUG5 572 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF365Q70YC5 407 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM199Q8N511 208 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC28A3Q9HAS3 691 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 CHD7Q9P2D1 2997 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 CSF2RAP15509 400 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 TINF2Q9BSI4 451 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 EPHX3Q9H6B9 360 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-214ENST00000592483 KAT14Q9H8E8 782 aa27.49■■□□□ 1.99
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