RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 CERS5Q8N5B7 392 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 MNS1Q8NEH6 495 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 ERO1AQ96HE7 468 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 CXorf56Q9H5V9 222 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 BTAF1O14981 1849 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD65E5RJM6 399 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 PLCG1P19174 1290 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 PAK1Q13153 545 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 DYMQ7RTS9 669 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 POTEDQ86YR6 584 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 TRIML1Q8N9V2 468 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 TBCKQ8TEA7 893 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 DBNDD1Q9H9R9 158 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 DISC1Q9NRI5 854 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 BARHL2Q9NY43 387 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 CALML3P27482 149 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 UBXN1Q04323 297 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 KCTD1Q719H9 257 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 CHP1Q99653 195 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 CASZ1Q86V15 1759 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 KCNJ18B7U540 433 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 PLA2G4AP47712 749 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 NFIAQ12857 509 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 KCNJ12Q14500 433 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 SUFUQ9UMX1 484 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 TDP2O95551 362 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 LDHCP07864 332 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 GSTO1P78417 241 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 CDKAL1Q5VV42 579 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 SLF1Q9BQI6 1058 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 POLD4Q9HCU8 107 aa16.9■□□□□ 0.3
CTIF-205ENST00000587860 POTEMA6NI47 508 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 TXLNAP40222 546 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 SRLQ86TD4 932 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 IRF6O14896 467 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 HSPA1LP34931 641 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 CCDC93Q567U6 631 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 NUDT12Q9BQG2 462 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 G3V3G9 751 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 TNNI2P48788 182 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 STK4Q13043 487 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 IRF2BP1Q8IU81 584 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 RNF217Q8TC41 542 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 UBXN4Q92575 508 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 TRIM47Q96LD4 638 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 HINFPQ9BQA5 517 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 M0R2N6 131 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 ZSCAN12O43309 604 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 STX10O60499 249 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 FILIP1LQ4L180 1135 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 PROM2Q8N271 834 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 L2HGDHQ9H9P8 463 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 RREB1Q92766 1687 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 MAFGO15525 162 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 SLC37A4O43826 429 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 BMP15O95972 392 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 PPP4CP60510 307 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 ERVK-24P63145 666 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 ASIC1P78348 528 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 SATB1Q01826 763 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 ZNF569Q5MCW4 686 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 SOGA3Q5TF21 947 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 CABP7Q86V35 215 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 USP40Q9NVE5 1235 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 KRT9P35527 623 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 CLCN6P51797 869 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 C16orf86Q6ZW13 317 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 FAM170AA1A519 330 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 B4DLN1 442 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 MFAP3LO75121 409 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 LRRC41Q15345 812 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-205ENST00000587860 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms